国鉄最初で最後の営業用ＶＶＶＦインバータ制御電車として１０両編成１本が試作され、昭和６１年１１月１日のダイヤ改正で常磐緩行線用に投入された車両です。 国鉄分割民営化も常磐緩行線で活躍しましたが、２０３系の後継車がＥ２３３系２０００番台に決まったため、平成２１年１２月５日をもって営業運転が終了となりました。
２０７系はＪＲ西日本にはありますが、２０７系９００番台とはまったく異なる車両で、９００番台車の量産車ではありません。

北柏−柏　平成１３年１月１４日

北小金−南柏（南柏駅から撮影）　平成１５年６月８日

我孫子駅　平成２１年１０月１４日

千代田線の輸送力増強のため、平成５年３月１８日のダイヤ改正から営業運転を開始した車両です。 当時、千代田線の車両は６０００系に統一されていましたが、６０００系は登場から約２０年が経過していたため、新世代の新しいデザインの車両となりました。 ０６系はこの１編成のみで、６０００系の代換えは１６０００系に決まったことから、平成２７年８月に運用離脱しました。

我孫子−北柏 （左写真は後追い撮影）　平成２２年１２月２９日

柏−北柏（後追い撮影）　平成２２年９月２７日

北小金−南柏（南柏駅から後追い撮影）　平成９年９月２０日

地下鉄開通７０周年記念ステッカー付です　南柏駅　平成９年９月２０日

南柏−北小金（後追い撮影）　平成２３年９月４日

常磐線各駅停車の列車増発に伴い、平成１１年１２月４日のダイヤ改正から営業運転を開始した車両です。 常磐線各駅停車は２０３系（一部上記の２０７系９００番台車）が活躍していましたが、ＪＲ通勤車両の標準仕様であるＶＶＶＦインバータ制御の２０９系が投入されました。 ただし、千代田線に乗り入れることから前面に貫通扉を設置した２０９系１０００番台となりました。 ２０３系の後継車がＥ２３３系２０００番台に決まったため、２０９系１０００番台はわずか２編成のみの製造にとどまりました。 平成２８年３月２６日のダイヤ改正で、常磐緩行線の車両が小田急電鉄に乗り入れるようになりましたが、２０９系１０００番台は乗り入れが見送られ常磐緩行線と千代田線内の限定運用として活躍を続けました。 しかし、中央線快速列車のＥ２３３系へのグリーン車組み込み工事の関係で豊田車両センターへの転属が決まり、平成３０年１０月１３日の「ありがとう２０９系常磐線各駅停車引退の旅」をもって常磐緩行線から撤退しました。

北柏−柏（後追い撮影）　平成１３年１０月２７日

北柏−柏　平成１７年７月９日

北柏−柏（後追い撮影）　平成３０年８月２５日

南柏−柏　平成１６年３月１４日

南柏−北小金　平成２３年１月３０日

南柏−北小金（北小金駅から撮影）　平成１２年１０月２２日

亀有−金町（亀有駅から後追い撮影）　平成１３年９月２日

ＥＦ５１０との顔合わせ 我孫子−北柏　平成２２年１２月４日

４８５系 宴との顔合わせ 南柏−北小金（南柏駅から後追い撮影）　平成２５年２月２４日

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